Mbeli est la plus grande des clairières qui parsèment les affluents de la rivière Ndoki et, à ce titre, elle a longtemps été un lieu privilégié pour la chasse et le braconnage des éléphants. La création du Parc National a mis fin à ces pratiques et les chercheurs ont commencé à travailler dans la clairière en 1994.
D'abord concentrés sur les gorilles, les chercheurs ont ensuite rapidement élargi leur champ d'étude et recueillent aujourd'hui diverses données sur les éléphants, les sitatungas et les buffles, ce qui a permis de faire des progrès sur différents sujets et de guider les politiques de conservation.
Pour ces espèces phares, chaque animal visitant la clairière est identifié individuellement par les chercheurs, ce qui permet de connaître l'histoire de la vie de certains d'entre eux sur une période pouvant aller jusqu'à 25 ans. À ce jour, l'équipe de recherche a identifié plus de 600 éléphants, 500 gorilles et 150 sitatungas. Le site de recherche de Mbeli Baï est le plus ancien site de recherche sur certaines de ces espèces.